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说出你要做的分析，
它一步步做完。

HelixMind 是本地优先的生物医学数据分析助手。用对话描述需求，它在常驻的 Python / R 会话里读数据、跑分析、出图表，每个结论都能追到是哪一步、哪段代码算出来的。

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macOS 14 及以上 · Windows 10 / 11（64 位）

PBMC 单细胞聚类

搜索任务

从原始数据，到能交付的结论

读数据、跑分析、看结果、查文献，在一个对话里完成。专业的东西都在一次点击之内，但不会默认铺满屏幕。

常驻的分析会话

数据读入一次，后面每一步接着用，不必每一步重新跑一遍脚本。Python 和 R 都能用，环境由应用创建和管理。

# 第 4 步，直接使用第 1 步读入的对象 >>> adata AnnData object with n_obs × n_vars = 2638 × 1838 obs: 'n_genes', 'pct_counts_mt', 'leiden' uns: 'pca', 'neighbors', 'umap', 'rank_genes_groups'

能交互的图

火山图、UMAP、热图等 40 多种图表可以悬停、框选、换配色，导出 PNG / SVG，也能导出绘图代码。

框选配色导出代码

专业查看器

序列、分子 3D 结构、病理切片、对接结果，按文件类型自动用合适的查看器打开。

文献调研

检索文献、下载 PDF、提取插图，和数据分析放在同一个任务里。

流程模板与设计器

单细胞标准流程等内置模板带步骤清单和检查项；也可以在资料库里可视化编排自己的流程。

越用越顺手

分析经验只从通过核验的运行里沉淀；长期记忆经你确认才生效，随时可以查看、修改、遗忘。

本机或远程服务器

小数据在自己电脑上分析；数据量大、要跑很久的任务，可以把执行位置换到你的远程服务器，进度照样实时显示，随时可以停止。

本地模型

可以接入本机的 Ollama，或在应用内直接运行小型本地模型。用本地模型时，对话和数据都不出你的电脑。

怎么用

三步，从一句话到一份结论

描述
用日常的话说出想做什么，上传或指定数据文件。不需要先写代码，也不需要自己配环境。
执行
它把需求拆成步骤，写代码并在分析会话里运行。写文件、跑代码、装包之前，按你选的确认方式先问你。
核验
每轮结束前核对声称的产出是否真的存在、数值能否追到来源。没通过，就把原因写在回答下面。

可信

只说真话

没跑的不说跑了，没核验的不说通过，换了模型会直接告诉你。原因写在界面上，而不是藏在悬停提示里。

产出核验

任务收尾时，对照磁盘上的实际文件核对模型"声称生成"的产出，假完成会直接在对话里标出来。

数值溯源

回答里的数字能追到是哪一步、哪段代码、哪份输出算出来的，点一下就跳到那一步。

来源证明

每条回答都记下用了哪个模型、哪个环境、哪次运行。

动手之前先问

写文件、运行代码、改动环境等操作按风险分级，需要时先征得你同意，随时可以停止。

对话级回滚

退回到某一句话之前，对话和文件一起还原；你之后亲手改过的文件不会被覆盖，跳过的会如实列出。

项目规则只能收紧

仓库里的 .aegis/ 配置只能额外禁止工具或强制审批，不能放宽任何权限。

差异表达完成：共 412 个基因上调、389 个下调（|log2FC| > 1，校正后 p < 0.05）。

模型: deepseek-chat
环境: R 4.3 · 分析环境
运行: 第 5 步 · DESeq2
产出: volcano.svg、deg.csv

已核验2 个产出文件均已找到，数值与输出一致

富集分析已完成，结果见 enrichment.csv。

声称生成的 enrichment.csv 在工作目录中不存在；上一步的代码因网络超时没有拿到通路数据库。

未通过本轮检查原因已写明，可以直接让它重试

工作方式

同一个菜单，两件事分开选

"动手前要不要问你"和"这件事用什么方法做"是两个问题。分成两组，就能选出"变更前确认 + 自主发现"这样的组合。

自主发现和多模型评议会多花模型调用，选中时菜单里直接写出大致倍数

模型

用你习惯的模型

填入自己的 API Key 即可使用；也可以接 OpenAI 兼容接口，或完全在本机运行。

DeepSeek智谱 GLMKimiMiniMax通义千问OpenAIOllamaOpenAI 兼容接口应用内本地模型

试用或下载 HelixMind

当前版本 0.20.0 · 网页版与桌面版是同一套界面

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不用安装，浏览器里直接打开 0.20.0 网页版。演示账号 demo · 密码 helixmind-demo；所有人共用这个演示账户，请勿上传真实数据。

打开网页版

安装包暂时关闭下载（正在准备签名与公证版本）。现在可以直接使用网页版；网页版运行在服务器上（内测），请勿上传敏感数据，如需在本地处理数据请等桌面版开放下载。

不需要预先安装 Python、R 或 conda，分析环境由应用自动准备。

常见问题

你可能想问

我的数据会被上传吗？

数据文件在你自己的电脑上分析，或者在你指定的远程服务器上分析。发送给模型供应商的是对话内容、代码和运行输出的摘要；选用本地模型时，这一步也留在本机。

需要自己安装 Python、R 或 conda 吗？

不需要。分析环境由应用创建和管理。安装新的包会改动环境，执行前会按你选的确认方式先征得同意。

它给出的结论可以直接用吗？

它会核对产出文件、追溯数值来源，没通过检查时会写明原因，但这些检查不能代替你的科学判断。每个结论都能点回对应的步骤和代码，方便你复核。

能跑耗时很长的分析吗？

可以。长任务在过程里显示实时进度，随时可以停止；数据量大时可以把执行位置换到远程服务器。

支持哪些模型？

DeepSeek、智谱、Kimi、MiniMax、通义千问、OpenAI，以及任何 OpenAI 兼容接口；也可以接本机的 Ollama，或在应用内运行小型本地模型。

说出你要做的分析，它一步步做完。

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